Küsimus:
Kuidas absoluutset konfiguratsiooni katseliselt määrata?
Mad Scientist
2012-05-05 03:11:47 UTC
view on stackexchange narkive permalink
Oletame, et sünteesisin või eraldasin kiraalse molekuli ja tahan teada selle molekuli absoluutset konfiguratsiooni (R või S). Ilmselt saaksin struktuuri lahendada röntgenkiirte kristallograafia abil, kuid see on palju tööd ja ma ei taha seda teha või mul ei pruugi olla juurdepääsu vajalikele seadmetele.

Milliseid muid võimalusi on molekuli absoluutne konfiguratsioon eksperimentaalselt?

Kaks vastused:
#1
+13
CHM
2012-05-05 07:30:37 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Kui teie ühendit on varem sünteesitud, saate mõõta selle optilist aktiivsust ja võrrelda seda kirjanduse andmetega.

Kui teie ühendit pole varem sünteesitud, siis saab NMR-meetodil on võimalik eristada kahte enantiomeeri, mõõtes oma molekuli spektreid kiraalses keskkonnas. Siin on ülevaateartikkel, kuidas lahutada enantiomeere NMR-iga.

Vastasel juhul saab diastereomeere hõlpsasti eristada. Oma molekuli vaadates saate (omamoodi) ennustada, millise spektri see peaks tekitama, kasutades enantiotoopsete, homotoopsete, heterotoopiliste ja diastereotoopsete prootonite mõisteid. Pidime eelmisel aastal analüüsima ja lahendama diastereomeeride 2D-TMR spektreid ( 1 H ja 13 C) ning algajale pean ütlema, et see oli väljakutse.

Nagu alati, moodustub sellest diastereomeeride moodustamine.

MUUDA

Vaadake neid diasteromeere:

Without getting into much detail

(Mul on ees finaalid), on lihtne näha, et hüdroksüül nihutab etüüli CH 2 piigid teise isomeeri madalama välja (suurema ppm) suunas. Kiraalse keskkonna NMR-spektrite tõlgendus peaks olema sarnane. Minu mulje on, et kiraalsete meediaspektrite omandamine on rohkem seotud, kuid tõlgendus mitte. Võib-olla olen siiski täiesti rajalt väljas.

Keegi soovib jagada põhjalikumat vastust.

NMR näib _ eristavat_ enantiomeere - kuid kas see võib teile öelda, kumb on? (Ma pole kindel, olen ainult artiklit koorinud). Kui jah, siis kas võiksite veidi öelda põhipõhjust, miks NMR seda lubab? Pole vajalik, kuid see muudaks teie postituse ägedaks.
Ma pole kunagi selliste spektritega töötanud. Kuna põhimõte on diastereomeeride genereerimine, arvan, et on võimalik määrata oma molekuli _ absoluutne_ konfiguratsioon, kui teate oma kiraalse keskkonna absoluutset konfiguratsiooni.
tõesti? Ma mõtlen, et vist suudate määrata dekstro ja laevo - kuid teil peab olema d / l ja R / S teoreetiline sobitamine. Ma kahtlen, kas toimub otsene eksperimentaalne sobitamine (st ilma, et teoreetiliselt neid kahte omavahel seostataks), kuna R / S prioriteetsüsteem on meelevaldne.
@Manishearth: Oh oota ... NMR võib seda teha. Võib olla. : /
#2
+11
Chris
2012-05-06 06:39:38 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Nagu oma postituses vihjasite, on XRC pika ajalooga absoluutne konfiguratsioonimäärang. Puuduseks on rohkem kui ressursid, sellistel põhjustel on kaastöölisi olemas, kuid raskem osa on tegelikult sobiva kristalli kasvatamine. Teil on vaja ka piisavalt raskeid aatomeid, mis tavaliselt sisestatakse derivatiseerimise teel, kui neid veel pole. Mõnikord võib sobiva kristalli saamiseks kuluda aastaid.

OR ja CD on varem konfiguratsiooni ennustamiseks kasutatud. Näiteks ei õpetata me seda tänapäeval, kuid CD-l töötamiseks töötati välja mitmesugused kiraalsuse reeglid. Need olid enamasti empiirilist laadi ja seetõttu oli neil palju erandeid. Täna on ab initio ajast sõltuva tiheduse funktsionaalse teooria arvutused, mis püüavad teha piisavalt täpseid arvutusi, et sellel areenil kasulik olla.

NMR-l on selle lahendamiseks ilmselt mõned lisameetodid, kuid ma ei tea midagi nende kohta.

Stereokontrollitud reaktsioonid on veel üks viis struktuuri tuletamiseks, kuid see nõuab sünteetilise ettevõtmisena palju aega ja vaeva ning on eriti kasutamatu kõigile farmaatsiatööstuses. Sünteesid on samuti veaohtlikud.

Kui soovite teada, mida farmaatsiatööstus teeb, kui ta ei suuda XRC-d teha, siis ärge otsige enam ebaõnnestunud ravimeid. Näiteks hinnati gossüpooli kui meeste rasestumisvastast kontrolli. See ebaõnnestus muu hulgas teatava pöördumatuse puudumise tõttu. Igatahes nimetatakse selle konformatsiooni ja absoluutse konfiguratsiooni määramiseks kasutatavat tehnikat vibratsiooniliseks ringdikroismiks ( VCD). Siinkohal peaksin mainima ka seda, et Ramani optiline aktiivsus (ROA) on teine ​​meetod, mis on mõnel juhul kasulik.

Kaasaegsed DFT-programmipaketid võimaldavad VCD-spektrite jaoks üsna mõistlikke prognoose võtta päeva järjestuses. Need arvutused on palju lihtsamad kui hea VÕI või CD jaoks vajalikud. Neid arvutatud spektreid võrreldakse eksperimentaalsetega ja siit saab määrata absoluutse konfiguratsiooni. Arvutuste kvaliteeti saab arvutatud ja mõõdetud IR-spektrite võrdlemisel hõlpsasti kindlaks määrata.

Tegelikult on põhiidee, et vibratsiooni ergastamisel on parema ja vasaku-ümmarguse polariseeritud valguse erinevad koostoimed. Nende vastuste erinevus on joonistatud lainearvule. Õige instrumendi puudumisel on see tehnika tõesti raske, kuid saab osta seadmeid, mis muudavad nende mõõtmise üsna lihtsaks. Sellega saate teha palju rohkem, kuid Big Pharma kasutab kindlasti VCD-d, kui XRC-le pole juurdepääs.



See küsimus ja vastus tõlgiti automaatselt inglise keelest.Algne sisu on saadaval stackexchange-is, mida täname cc by-sa 3.0-litsentsi eest, mille all seda levitatakse.
Loading...